Un port natural és una entrada en una costa, com una cala, badia, estuari, fiord, etc. que permet que els vaixells atraquin i s'hi refugiin. El calat i les dimensions del port natural que permetin les maniobres (atracament, marxa enrere, etc.) determinaran la mida de les embarcacions que podran utilitzar-lo.
Un port natural pot ser parcialment o totalment artificialitzat posteriorment ; s'oposa als ports construïts ex nihilo, ja sigui creant molls mitjançant dragatge i excavació del litoral o construint dics i espigons com protecció de la costa.