| 2016 West Florida Argonauts football | |
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| Conference | Gulf South Conference |
| Record | 5–6 (3–5 GSC) |
| Head coach |
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| Offensive coordinator | Jammie Deese (1st season) |
| Defensive coordinator | Cory Sanders (1st season) |
| Home stadium | Blue Wahoos Stadium |
| Conf | Overall | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Team | W | L | W | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| No. 2 North Alabama $^ | 7 | – | 0 | 11 | – | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| No. 18 Valdosta State ^ | 6 | – | 2 | 8 | – | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| West Alabama | 6 | – | 2 | 7 | – | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Florida Tech ^ | 5 | – | 2 | 8 | – | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| West Georgia | 4 | – | 4 | 7 | – | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| West Florida | 3 | – | 5 | 5 | – | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Delta State † | 3 | – | 5 | 4 | – | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mississippi College | 1 | – | 7 | 3 | – | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Shorter | 0 | – | 8 | 0 | – | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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The 2016 West Florida Argonauts football team represented the University of West Florida in the 2016 NCAA Division II football season. They were led by head coach Pete Shinnick, who was in his first season at West Florida for the team's inaugural season. The Argonauts played their home games at Blue Wahoos Stadium and were members of the Gulf South Conference. They finished the season with a record of 5 wins and 6 losses (5–6 overall, 3–5 in the GSC), defeating one top 25 ranked team and were not invited in the 2016 playoffs.