El Gobierno Metropolitano de Tokio es un organismo público gubernamental que rige sobre las urbanizaciones contenidas en la Metrópolis de Tokio, Japón. En general, toma la administración de los servicios generales de los 23 barrios especiales, 26 ciudades, 8 villas y 5 pueblos que componen la Metrópolis de Tokio; mientras que los gobiernos locales comúnmente administran los servicios más cercanos a la población o de interés local.
El poder ejecutivo del Gobierno Metropolitano de Tokio recae en el Gobernador, quien es electo por los ciudadanos para un período de cuatro años.
El principal órgano de representantes es la Asamblea Metropolitana de Tokio, compuesta de 127 representantes electos por un período de cuatro años. La Asamblea tiene la facultad de emitir, ejercer o rechazar ordenanzas públicas; verificar la asignación del presupuesto público, y ratificar a quienes son propuestos por el gobernador, como el vicegobernador y el contralor general de Tokio. Como representantes de la población, la Asamblea tiene también la facultad de investigar e inspeccionar todos los aspectos relacionados con la administración pública de la metrópolis.