Pseudomonadota

Pseudomonadota

Taxonomía
Dominio: Bacteria
(sin rango) Gracilicutes
Filo: Pseudomonadota
Garrity, 2021
Subfilos y clases
Sinonimia
  • Proteobacteria, Stackebrandt et al., 1988

Pseudomonadota o Proteobacteria son un filo de bacterias. Incluyen una gran variedad de patógenos, tales como Escherichia coli, Salmonella, Vibrio, Helicobacter, Neisseria, Burkholderia glumae y muchos otros.[1]​ Otras son de vida libre, e incluyen muchas de las bacterias responsables de la fijación del nitrógeno.

El filo se estableció inicialmente en términos de secuencias de ARNr, denominándose "bacterias púrpuras y relacionadas" (Woese 1987)[2]​ y luego se les llamó Proteobacteria en honor al dios griego Proteus, el cual podía cambiar de forma, dada la gran diversidad de formas encontradas en ellas.[3]​ La filogenia del genoma y el proteoma han validado este grupo. En 2021 el nombre del filo fue cambiado a Pseudomonadota[4]​, sin embargo el cambio de nombre de varios filos de procariotas en 2021, incluido Pseudomonadota, sigue siendo controvertido entre los microbiólogos, muchos de los cuales continúan usando el nombre anterior Proteobacteria, de larga data en la literatura.[5]

Recientemente se propuso que las proteobacterias deberían considerarse un superfilo y que sus clases comprenderían filos separados por derecho propio, junto con otros filos bacterianos descubiertos recientemente.[6]​ De está manera se propuso clasificar a las epsilonproteobacterias en un filo Campylobacterota y las deltaproteobacterias en dos filos Myxococcota y Bdellovibrionota, sin embargo dicha clasificación no es aceptada por el LPSN.[7]

Todas las proteobacterias son Gram negativas, con una pared celular formada principalmente de lipopolisacáridos, su morfología es muy variable, desde bacilos, hastas cocos simples hasta géneros con prosteca, y más e incluso cuerpos fructíferos. Muchas se mueven utilizando flagelos, pero algunas lo pueden hacer por deslizamiento bacterial. Entre estas se encuentran las mixobacterias, un grupo único de bacterias que pueden agruparse para formar cuerpos fructíferos.

Tienen también una gran variedad de tipos de metabolismo. La mayoría de las proteobacterias son anaerobias, pero hay muchas excepciones. Las mitocondrias que permiten respirar a las células eucariotas se derivan de proteobacterias, probablemente similares a las rickettsias.

La nutrición es usualmente heterótrofa, pero hay dos grupos que realizan la fotosíntesis, denominadas bacterias púrpuras. Las bacterias púrpuras del azufre usan azufre o sulfuro de hidrógeno como donante de electrones, mientras que las bacterias púrpuras no del azufre utilizan hidrógeno. Puesto que esta función no es realizada por el agua, como es común en plantas y cyanobacterias, no se produce oxígeno.

Las proteobacterias son los seres más abundantes en los océanos y otros ambientes acuáticos. En el fondo marino constituye el 79% de la biomasa bacteriana, en la superficie del mar un 64% y en agua dulce 40%.[8]

Para su clasificación, las proteobacterias se dividen en seis clases, según los estudios filogenéticos, y se denominan según las letras griegas α, β, γ, δ, ε y ζ. Estas clases pueden agruparse en los siguientes grupos:

  1. Madigan M; Martinko J (editors). (2005). Brock Biology of Microorganisms (11th ed. edición). Prentice Hall. ISBN 0-13-144329-1. 
  2. Woese, CR (1987). "Bacterial evolution". Microbiological reviews 51 (2): 221–71. PMC 373105. PMID 2439888
  3. «Proteobacteria». Discover Life: Tree of Life. Consultado el 9 de febrero de 2007. 
  4. Staff, NCBI (10 de diciembre de 2021). «NCBI Taxonomy to include phylum rank in taxonomic names». NCBI Insights (en inglés estadounidense). Consultado el 2 de enero de 2024. 
  5. «Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar». 
  6. Yarza P (2014). «Uniting the classification of cultured and uncultured bacteria and archaea using 16S rRNA gene sequences». Nature Reviews Microbiology 12 (9): 635-645. PMID 25118885. S2CID 21895693. doi:10.1038/nrmicro3331. hdl:10261/123763. 
  7. Pseudomonadota. LPSN.
  8. Battistuzzi & Hedges 2008. A Major Clade of Prokaryotes with Ancient Adaptations to Life on Land. Multiple Evidence Supporting Two Major Groups of Eubacteria. Mol Biol Evol (2009) 26 (2): 335-343. doi: 10.1093/molbev/msn247