Pour les articles homonymes, voir Blast.
BLAST
| Développé par | Altschul S.F., Gish W., Miller E.W., Lipman D.J., NCBI |
|---|---|
| Dernière version | 2.9.0+ () |
| Écrit en | C++ et C |
| Système d'exploitation | Type Unix, Linux, macOS et Microsoft Windows |
| Environnement | Multiplate-forme |
| Formats lus | XML BLAST Output (d) |
| Formats écrits | XML BLAST Output (d) |
| Type | Outil bioinformatique |
| Licence | Domaine public |
| Site web | blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi |
BLAST (acronyme de basic local alignment search tool) est une méthode de recherche heuristique utilisée en bioinformatique. Il permet de trouver les régions similaires entre deux ou plusieurs séquences de nucléotides ou d'acides aminés, et de réaliser un alignement de ces régions homologues.
Étant donné une séquence introduite par l'utilisateur, BLAST permet de retrouver rapidement dans des bases de données, les séquences répertoriées ayant des zones de similitude avec la séquence d'entrée[1]. Cette méthode est utilisée pour trouver des relations fonctionnelles ou évolutives entre les séquences et peut aider à identifier les membres d'une même famille de gènes.
- Greg Gibson, Spencer V. Muse, Lionel Domenjoud, Raymond Cunin (trad. Lionel Domenjoud), Précis de génomique, Bruxelles/Paris, De Boeck Université, , 347 p. (ISBN 2-8041-4334-1), « 2 »