BatCoV RaTG13

BatCov RaTG13
Description de l'image Defaut 2.svg.
Classification
Domaine Riboviria
Règne Orthornavirae
Embranchement Pisuviricota
Classe Pisoniviricetes
Ordre Nidovirales
Sous-ordre Cornidovirineae
Famille Coronaviridae
Sous-famille Orthocoronavirinae
Genre Betacoronavirus
Sous-genre Sarbecovirus
Espèce SARSr-CoV

forme

Bat SL-CoV RaTG13
 

Synonymes

  • BatCoV Ra4991

Classification phylogénétique

Position :

Le Coronavirus de chauve-souris RaTG13 lié au SRAS ou Bat SL-CoV RaTG13 est une souche de betacoronavirus qui infecte la chauve-souris Rhinolophe fer à cheval intermédiaire (Rhinolophus affinis).

Elle a été découverte en 2013 dans des excréments de chauves-souris d'une grotte minière près de la ville de Tongguan du xian autonome hani de Mojiang dans le Yunnan en Chine. C'est le plus proche parent connu du SARS-CoV-2, virus qui cause la COVID-19[2],[3].

C'est une souche de coronavirus (CoV), infectant la chauve-souris (bat en anglais), d'où l'abréviation BatCoV (ou BtCoV)[4],[5].

Le nom de la souche elle-même comporte l'espèce porteuse (Ra – Rhinolophus affinis), le lieu de découverte (TG – Tongguan), et l'année de découverte (13 – 2013), soit « RaTG13 ».

  1. (en) Maciej F. Boni, Philippe Lemey, Xiaowei Jiang, Tommy Tsan-Yuk Lam, Blair W. Perry, Todd A. Castoe, Andrew Rambaut et David L. Robertson, « Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic », Nature Microbiology, vol. 5, no 11,‎ , p. 1408-1417 (PMID 32724171, DOI 10.1038/s41564-020-0771-4, lire en ligne)
  2. Poudel U, Subedi D, Pantha S, Dhakal S, « Animal coronaviruses and coronavirus disease 2019: Lesson for One Health approach », Open Veterinary Journal, vol. 10, no 3,‎ , p. 239–251 (PMID 33282694, PMCID 7703617, DOI 10.4314/ovj.v10i3.1 Accès libre)
  3. Xiao C, Li X, Liu S, Sang Y, Gao SJ, Gao F, « HIV-1 did not contribute to the 2019-nCoV genome », Emerging Microbes & Infections, vol. 9, no 1,‎ , p. 378–381 (PMID 32056509, PMCID 7033698, DOI 10.1080/22221751.2020.1727299 Accès libre)
  4. Ge XY, Wang N, Zhang W, Hu B, Li B, Zhang YZ, Zhou JH, Luo CM, Yang XL, Wu LJ, Wang B, Zhang Y, Li ZX, Shi ZL, « Coexistence of multiple coronaviruses in several bat colonies in an abandoned mineshaft », Virologica Sinica, vol. 31, no 1,‎ , p. 31–40 (PMID 26920708, PMCID 7090819, DOI 10.1007/s12250-016-3713-9)
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