La commission pontificale Ecclesia Dei était un dicastère de la curie romaine fondé en 1988 par le motu proprio Ecclesia Dei du pape Jean-Paul II, à la suite du sacre d'évêques au sein de la Fraternité sacerdotale Saint-Pie-X contre la volonté expresse du pape[1]. La structure de la commission a été refondue par le motu proprio Ecclesiae unitatem du , en la liant étroitement à la Congrégation pour la doctrine de la foi[2]. La commission a été supprimée le par le pape François, qui en a transféré les activités à la Congrégation pour la doctrine de la foi.