Lunes d'encre est une collection de romans de science-fiction créée en 1999 par les éditions Denoël.
Fondée par Gilles Dumay, cette collection propose des textes de science-fiction, de fantasy et de fantastique. Parmi les auteurs publiés, l'ancienne génération (Jack Vance, Roger Zelazny, Isaac Asimov…) côtoie la nouvelle garde (Ted Chiang, Hal Duncan, Laurent Kloetzer…).
La création de Lunes d'encre s'inscrit dans le contexte d'une profonde refonte de l'édition de science-fiction chez Denoël : la collection Présence du futur est arrêtée, son activité continuant sous le label Folio SF dans une logique de groupe, Denoël appartenant aux éditions Gallimard. De même la collection Présences est arrêtée : Lunes d'encre est créée pour prendre sa succession et continuer à publier de la science-fiction en grand format au sein de Denoël[1].
Gilles Dumay quitte ses fonctions après dix-huit années de direction fin et il est remplacé par Pascal Godbillon, directeur de la collection Folio SF depuis 2006, collection dont il reste le directeur[2].