L’utilisation des antibiotiques en agriculture concerne un nombre limité d'antibiotiques qui sont autorisés dans certains pays pour lutter contre certaines maladies bactériennes des plantes. C'est le cas en particulier de la streptomycine qui s'est révélée très efficace dans la lutte contre le feu bactérien causé par Erwinia amylovora, notamment chez les pommiers et poiriers[1]. Cette utilisation est marginale comparée à l'usage des antibiotiques en élevage. À titre d'exemple aux États-Unis en 2009, la quantité d'antibiotiques utilisées dans les vergers n'a représenté que 0,12 % de la quantité totale d'antibiotiques administrés aux animaux d'élevage[2].