| 2006 Nicholls State Colonels football | |
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| Conference | Southland Conference |
| Record | 4–7 (2–4 Southland) |
| Head coach |
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| Offensive coordinator | H. T. Kinney (3rd season) |
| Defensive coordinator | Steve Ellis (1st season) |
| Home stadium | John L. Guidry Stadium |
| Conf | Overall | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Team | W | L | W | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| No. 21 McNeese State $^ | 5 | – | 1 | 7 | – | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sam Houston State | 4 | – | 2 | 6 | – | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stephen F. Austin | 4 | – | 2 | 4 | – | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Texas State | 3 | – | 3 | 5 | – | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nicholls State | 2 | – | 4 | 4 | – | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Northwestern State | 2 | – | 4 | 4 | – | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Southeastern Louisiana | 1 | – | 5 | 2 | – | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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The 2006 Nicholls State Colonels football team represented Nicholls State University as a member of the Southland Conference during the 2006 NCAA Division I FCS football season. Led by third-year head Jay Thomas, the Colonels compiled an overall record of 4–7 with a mark of 2–4 in conference play, tying for fifth place in the Southland. Nicholls State played home games at John L. Guidry Stadium in Thibodaux, Louisiana.