| Teams | 6 |
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| Format | Double-elimination |
| Finals site | |
| Champions | Binghamton (4th title) |
| Conf | Overall | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Team | W | L | PCT | W | L | PCT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binghamton †‡y | 19 | – | 5 | .792 | 30 | – | 25 | .545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hartford | 14 | – | 9 | .609 | 37 | – | 18 | .673 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stony Brook | 13 | – | 9 | .591 | 32 | – | 25 | .561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UMBC | 13 | – | 10 | .565 | 22 | – | 29 | .431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Albany | 9 | – | 14 | .391 | 23 | – | 30 | .434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Maine | 8 | – | 15 | .348 | 20 | – | 35 | .364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UMass Lowell * | 5 | – | 19 | .208 | 20 | – | 32 | .385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| † – Conference champion ‡ – Tournament champion y – Invited to the NCAA tournament
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The 2016 America East Conference baseball tournament was held from May 25 through 28, 2016. All six eligible participants out of the league's seven teams met in the double-elimination tournament to be held at Edward A. LeLacheur Park in Lowell, Massachusetts, the home park of UMass Lowell.[2][3] Binghamton won the championship and received the conference's automatic bid to the 2016 NCAA Division I baseball tournament.